BIOINFORMATIKA

Posted by Unknown | Posted in | Posted on 10.52



Bioinformatics tools in predictive ecology:
applications to fisheries
Allan Tucker1, and Daniel Duplisea

Bioinformatika di bidang perikanan adalalah segala bentuk informasi dan segala bentuk teknologi yang mendukung kegiatan dalam bidang perikanan seperti , rekayasa genetika, penerapan teknologi tepatguna, modifikasi pakan bagi kultivan yang dipelihara, dan lain-lain. Telah ada upaya besar dalam kemajuan teknik analisis untuk data molekul biologi selama dekade terakhir. Hal ini telah menyebabkan banyak algoritma baru yang khusus untuk menangani data yang terkait dengan fenomena biologis, seperti ekspresi gen dan interaksi protein.


Bioinformatika telah merevolusi cara dalam menganalisis data biologi molekuler. Karena ledakan di pengumpulan data dan penyimpanan data, telah ada tuntutan untuk teknik spesialis dalam menganalisa model data seperti eksperimen microarray, yang dapat mengukur ekspresi ribuan gen secara bersamaan. Kemajuan dalam penelitian di bidang tersebut termasuk pembelajaran analisis data yang cerdas dan telah mengakibatkan banyak alat baru untuk menganalisis. Salah satu teknik seperti clustering pada awalnya sangat populer untuk mengidentifikasi kelompok gen dengan profil ekspresi yang sama. Hal ini memungkinkan ahli biologi untuk mengidentifikasi susunan gen dan mengurangi jumlah besar variabel ketika membentuk model untuk prediksi. 

Sejak penurunan drastis dari populasi ikan yang terjadi di beberapa kawasan di seluruh dunia muncul penelitian tentang penyebab dari hal tersebut. Penelitian ini meliputi spesies, serta efek tidak langsung dari modifikasi dari jaring makanan dan struktur fungsional. penggunaan teknologi informasi terbaru dan BNS (jaringan bayesian) adalah metode lain yang diterapkan pada masalah ini.

Jurnal ini fokus pada penerapan teknik bioinformatika yang digunakan untuk biomassa. Data diambil dari Georges Bank (GB), Timur Scotian Shelf (ESS) dan Laut Utara (NS) antara tahun 1960 dan 2007.  Penelitia yang dilakukan fokus pada biomassa ikan cod yang mengalami penurunan drastis 20 tahun terakhir. Hal tersebut sebagian besar disebabkan oleh kematian karena penangkapan dan lemahnya interaksi spesies tersebut baik dengan spesies lain maupun dengan lingkungan sekitar.

Comments (0)

Posting Komentar