BIOINFORMATIKA
Posted by Unknown | Posted in | Posted on 10.52
Bioinformatics tools in predictive
ecology:
applications
to fisheries
Allan Tucker1, and Daniel Duplisea
Bioinformatika
di bidang perikanan adalalah segala bentuk informasi dan segala bentuk
teknologi yang mendukung kegiatan dalam bidang perikanan seperti , rekayasa genetika,
penerapan teknologi tepatguna, modifikasi pakan bagi kultivan yang dipelihara,
dan lain-lain. Telah ada
upaya besar dalam kemajuan teknik analisis untuk data molekul biologi selama
dekade terakhir. Hal ini telah menyebabkan banyak algoritma baru yang khusus
untuk menangani data yang terkait dengan fenomena biologis, seperti ekspresi
gen dan interaksi protein.
Bioinformatika
telah merevolusi cara dalam menganalisis data biologi molekuler. Karena ledakan
di pengumpulan data dan penyimpanan data, telah ada tuntutan untuk teknik
spesialis dalam menganalisa model data seperti eksperimen microarray, yang dapat
mengukur ekspresi ribuan gen secara bersamaan. Kemajuan dalam penelitian di
bidang tersebut termasuk pembelajaran analisis data yang cerdas dan telah
mengakibatkan banyak alat baru untuk menganalisis. Salah satu teknik seperti
clustering pada awalnya sangat populer untuk mengidentifikasi kelompok gen
dengan profil ekspresi yang sama. Hal ini memungkinkan ahli biologi untuk
mengidentifikasi susunan gen dan mengurangi jumlah besar variabel ketika membentuk
model untuk prediksi.
Sejak
penurunan drastis dari populasi ikan yang terjadi di beberapa kawasan di
seluruh dunia muncul penelitian tentang penyebab dari hal tersebut. Penelitian
ini meliputi spesies, serta efek tidak langsung dari modifikasi dari jaring
makanan dan struktur fungsional. penggunaan teknologi informasi terbaru dan BNS
(jaringan bayesian) adalah metode lain yang diterapkan pada masalah ini.
Jurnal
ini fokus pada penerapan teknik bioinformatika yang digunakan untuk biomassa. Data
diambil dari Georges Bank (GB), Timur Scotian Shelf (ESS) dan Laut Utara (NS)
antara tahun 1960 dan 2007. Penelitia
yang dilakukan fokus pada biomassa ikan cod yang mengalami penurunan drastis 20
tahun terakhir. Hal tersebut sebagian besar disebabkan oleh kematian karena
penangkapan dan lemahnya interaksi spesies tersebut baik dengan spesies lain
maupun dengan lingkungan sekitar.
.jpg)
Comments (0)
Posting Komentar